วัดญวนในประเทศไทยโดยทั่วไปมีลักษณะการผสมผสานศิลปกรรมระหว่างจีน ญวน และไทย แต่ค่อนข้างเด่นไปทางสถาปัตยกรรมแบบจีน มียันต์ลักษณะทรงกลมแบบจีนประดับบนผนังด้านนอกของตัวอุโบสถ ส่วนตัวอุโบสถของวัดญวนส่วนใหญ่ได้มีการบูรณะขึ้นใหม่แต่ก็ยังมีส่วนที่คงของเดิมไว้บ้าง เช่น เสาและพื้นอุโบสถ ลักษณะศิลปะบนเสาบางวัด เช่น วัดอุภัยราชบำรุงที่ตลาดน้อย มีการวาดลวดลายมังกรขึ้นมาใหม่ ส่วนรูปทรงของพระพุทธรูปและองค์พระต่าง ๆ คล้ายคลึงกับลักษณะของพระจีนมาก องค์พระที่ถือเป็นสัญลักษณ์เด่นของวัดญวนมีชื่อว่า "ท้าวมหาชมพู"
สถาปัตยกรรมของวัดญวนแตกต่างจากวัดไทยเนื่องจากวัดไทยนั้นมักสร้างอาคารมีช่อฟ้า ใบระกา และหางหงส์ ส่วนวัดญวนไม่มีศิลปกรรมดังกล่าว วัดญวนส่วนใหญ่ เช่น วัดถาวรวราราม จังหวัดกาญจนบุรี วัดสมณานัมบริหาร วัดอุภัยราชบำรุง และวัดกุศลสมาคร ในกรุงเทพฯ มีการสร้างเจดีย์ประดับกระเบื้องสีสำหรับบรรจุอัฐิของบรรพบุรุษซึ่งรวมถึงเจดีย์ที่บรรจุอัฐิของพระยาโชฎึกราชเศรษฐีที่วัดกุศลสมาครด้วย นอกจากนั้นบางวัดยังมีหอกลองและหอระฆังแต่มักใช้เฉพาะช่วงเข้าพรรษาและงานวัดเป็นบางโอกาสเท่านั้น